| Sádek u Žatce | 528 | Ž S T | |
| Sadov | 536 | D 3 | |
| Sadská | 502 | Ž S T | |
| Salajna | 713 | Ž S T | |
| Samechov | 516 | Ž S T | |
| Sázava u Žďáru | 324 | Ž S T | |
| Sázava - Černé Budy | 516 | Ž S T | |
| Sebuzín | 503 | Ž S T | |
| Sedlčany | 514 | D 3 | |
| Sedlejov | 701 | Ž S T | |
| Sedlice | 716 | D 3 | |
| Sedlnice | 306 | Ž S T | |
| Semily | 508 | Ž S T | |
| Senice na Hané | 313 | Ž S T | |
| Senohraby | 519 | Ž S T | |
| Senomaty | 522 | D 3 | |
| Skalice nad Svitavou | 314, 326 | Ž S T | VS 342 |
| Skalice u České Lípy | 540 | Ž S T | |
| Skalná | 543 | D 3 | |
| Skalsko | 542 | D 3 | |
| Sklené nad Oslavou | 324 | Ž S T | |
| Skovice | 515 | D 3 | |
| Skrochovice | 307 | Ž S T | |
| Skuteč | 507 | Ž S T | |
| Slaný | 529 | Ž S T | VS 539 |
| Slapy | 702 | D 3 | |
| Slatina nad Zdobnicí | 513 | D 3 | |
| Slatiňany | 507 | Ž S T | |
| Slavičín | 317 | Ž S T | |
| Slavkov u Brna | 318 | Ž S T | |
| Slavonice | 701 | Ž S T | |
| Slezské Rudoltice | 312 | D 3 | |
| Smidary | 510 | Ž S T | |
| Smiřice | 505, 511 | Ž S T | |
| Smržovka | 548 | Ž S T | |
| Soběslav | 704 | Ž S T | |
| Sobotka | 542 | D 3 | |
| Sokolnice | 315 | Ž S T | |
| Sokolov | 533 + soukr. žel. | Ž S T | VS 714 |
| Solnice | 513 | Ž S T | |
| Spělov | 701 | výhybna | |
| Srní u České Lípy | 540 | Ž S T | |
| Staňkov | 712, 717 | Ž S T | |
| Stará Boleslav | 503 | Ž S T | |
| Stará Paka | 508, 510, 542 | Ž S T | VS 507 |
| Stará Role | 536 | Ž S T | |
| Staré Město pod Sněžníkem | 312 | D 3 | |
| Staré Město u Uh. Hradiště | 316, 317 | Ž S T | VS 332 |
| Staré Sedliště | 717 | D 3 | |
| Starkoč | 506, 509 | Ž S T | |
| Starý Plzenec | 709 | Ž S T | |
| Stařeč | 322 | Ž S T | |
| Stéblová | 505 | Ž S T | |
| Stod | 712 | Ž S T | |
| Stochov | 528 | Ž S T | |
| Stožec | 707 | D 3 | |
| Strakonice | 707, 709, 716 | Ž S T | VS 717 |
| Strančice | 519 | Ž S T | |
| Straškov | 530 | Ž S T | |
| Stráž nad Ohří | 533 | Ž S T | |
| Stráž u Tachova | 717 | D 3 | |
| Strážnice | 318 | Ž S T | |
| Strunkovice nad Blanicí | 708 | D 3 | |
| Strunkovice nad Volyňkou | 707 | D 3 | |
| Stružnice | 545 | Ž S T | |
| Středokluky | 529 | Ž S T | |
| Střelice | 322, 323 | Ž S T | |
| Střelské Hoštice | 709 | Ž S T | |
| Střezimíř | 704 | Ž S T | |
| Stříbro | 713 | Ž S T | |
| Střítež nad Bečvou | 302 | D 3 | |
| Studenec | 322, 325 | Ž S T | |
| Studénka | 305, 306 | Ž S T | VS 317 |
| Stupno | 714 | D 3 | |
| Sudoměřice nad Moravou | 318 | Ž S T | |
| Sudoměřice u Bechyně | 702 | D 3 | |
| Sudoměřice u Tábora | 704 | Ž S T | |
| Suchdol nad Lužnicí | 705 | Ž S T | |
| Suchdol nad Odrou | 305, 306 | Ž S T | VS 318 |
| Sušice | 710 | Ž S T | |
| Svatobořice | 319 | D 3 | |
| Svatoňovice | 306 | D 3 | |
| Světec | 504 | Ž S T | |
| Světlá Hora | 310 | D 3 | |
| Světlá nad Sázavou | 324, 516 | Ž S T | VS 516 |
| Svitavy | 326, 507 | Ž S T | |
| Svoboda nad Úpou | Dopravce: VIAMONT | nz | (510) |
| Svobodné Heřmanice | 307 | D 3 | |
| Svojetín | 531 | Ž S T | |
| Svojšín | 713, 717 | Ž S T | |
| Svor | 540 | Ž S T | |
| Sychrov | 508 | Ž S T |
| Šakvice | 320, 321 | Ž S T | |
| Šatov | 322 | Ž S T | PPS |
| Šebetov | 314 | Ž S T | |
| Ševětín | 704 | Ž S T | |
| Široká Niva | Dopravce: OKD-D | D 3 | (310) |
| Šlapanice | 318 | Ž S T | |
| Šlapanov | 701 | Ž S T | |
| Šluknov | 546 | Ž S T | |
| Špičák | 711 | Ž S T | |
| Štědrá | 522 | D 3 | |
| Štěpánov | 309 | Ž S T | |
| Šternberk | 311 | Ž S T | |
| Štětí | 503 | Ž S T | |
| Štětkovice | 514 | D 3 | |
| Štítina | 301 | Ž S T | |
| Štíty | 512 | D 3 | |
| Štramberk | 306 | Ž S T | |
| Šumná | 322 | Ž S T | |
| Šumperk | 311 + soukr. žel. DESNÁ | Ž S T | VS 327 |
| Švihov u Klatov | 711 | Ž S T |
| Tábor | 702, 703, 704 | Ž S T | VS 723 |
| Tachov | 717 | Ž S T | |
| Tanvald | 548 | Ž S T | |
| Těchonín | 512 | Ž S T | |
| Telč | 701 | Ž S T | |
| Telnice | 535 | D 3 | |
| Temelín | 708 | Ž S T | |
| Teplá | 536 | D 3 | |
| Teplice lesní brána | 535 | Ž S T | |
| Teplice nad Metují | 506, 509 | Ž S T | |
| Teplice v Čechách | 504 | Ž S T | |
| Teplička u Karlových Varů | 536 | D 3 | |
| Tetčice | 322 | Ž S T | |
| Tišnov | 324, 325 | Ž S T | VS 341 |
| Tlumačov | 316 | Ž S T | |
| Tochovice | 715 | Ž S T | |
| Tomice | 704 | Ž S T | |
| Toužim | 522 | D 3 | |
| Trhový Štěpánov | 514 | Ž S T | |
| Trmice | 504 | Ž S T | |
| Trnovany | 528 | Ž S T | |
| Troubelice | 311 | Ž S T | |
| Trpísty | 714 | D 3 | |
| Tršnice | 533, 543 | Ž S T | VS 713 |
| Trutnov hlavní nádraží | 509, 510 | Ž S T | VS 506 |
| Trutnov střed | 509 | Ž S T | |
| Trutnov - Poříčí | 509 | Ž S T | |
| Třebčín | 313 | Ž S T | |
| Třebechovice pod Orebem | 505 | Ž S T | |
| Třebelovice | 322 | D 3 | od 29.2.04 |
| Třebenice | 539 | D 3 | |
| Třebětice | 304 | Ž S T | |
| Třebíč | 322 | Ž S T | |
| Třebívlice | 539 | D 3 | |
| Třeboň | 705 | Ž S T | |
| Třebovice v Čechách | 309, 314 | Ž S T | |
| Třebušice | 504 | Ž S T | |
| Třemešná ve Slezsku | 311, 312 | Ž S T | styk ÚR |
| Třemešné pod Přimdou | 717 | D 3 | |
| Třemošná u Plzně | 719 | Ž S T | |
| Třemošnice | 515 | D 3 | |
| Třešť | 701 | Ž S T | |
| Třinec | 301 | Ž S T | VS 301 |
| Turnov | 508, 511, 537 | Ž S T | VS 526 |
| Tvršice | 531 | Ž S T | |
| Týn nad Vltavou | 708 | D 3 | |
| Týnec nad Sázavou | 523 | Ž S T | |
| Týniště nad Orlicí | 505, 506, 513 | Ž S T | VS 505 |
| Uherské Hradiště | 317 | Ž S T | |
| Uhersko | 501 | Ž S T | |
| Uherský Brod | 317 | Ž S T | |
| Uherský Ostroh | 317 | Ž S T | |
| Uhlířské Janovice | 518 | Ž S T | |
| Uhřice u Kyjova | 319 | D 3 | |
| Újezd u Chocně | 505 | Ž S T | |
| Újezd u Uničova | 311 | Ž S T | |
| Újezdec u Luhačovic | 317 | Ž S T | |
| Unhošť | 528 | Ž S T | |
| Uničov | 311 | Ž S T | |
| Úpořiny | 504, 539 | Ž S T | |
| Ústí nad Labem | |||
| Ústí nad Labem hlavní nádraží | 504, 527 | Ž S T | |
| Ústí nad Labem hl.n. - obvod jih | 527 | ||
| Ústí nad Labem hl.n. - obvod sever | 527 | VS 534 | |
| Ústí nad Labem západ | 503, 504 | Ž S T | VS 535 |
| Ústí nad Labem - Střekov | 503 | Ž S T | VS 531 |
| Ústí nad Orlicí | 501, 512 | Ž S T | VS 502 |
| Úštěk | 539 | Ž S T | |
| Úvaly | 501 | Ž S T | |
| Úžice | 532 | Ž S T | |
| Václavice | 506 | Ž S T | |
| Valašská Polanka | 308 | Ž S T | |
| Valašské Klobouky | 304 | D 3 | |
| Valašské Meziříčí | 302, 304, 308 | Ž S T | VS 323 |
| Valšov | 310 | Ž S T | |
| Valtice | 323 | Ž S T | |
| Valy u Mariánských Lázní | 713 | Ž S T | |
| Vamberk | 513 | Ž S T | |
| Vápenná | 312 | Ž S T | |
| Varnsdorf | 545, 547 | Ž S T | VS 525 |
| Včelná | 706 | Ž S T | |
| Vejprnice | 712 | Ž S T | |
| Vejprty | 534 | Ž S T | |
| Veleliby | 541 | Ž S T | |
| Velešín | 706 | Ž S T | |
| Velim | 501 | Ž S T | |
| Velká Bystřice | 310 | Ž S T | |
| Velká Kraš | 312 | Ž S T | |
| Velká nad Veličkou | 318 | Ž S T | |
| Velké Březno | 503 | Ž S T | |
| Velké Hamry | 548 | Ž S T | |
| Velké Hydčice | 710 | Ž S T | |
| Velké Karlovice | 304 | D 3 | |
| Velké Meziříčí | 325 | Ž S T | |
| Velké Opatovice | 314 | Ž S T | |
| Velké Pavlovice | 319 | Ž S T | |
| Velké Žernoseky | 503, 539 | Ž S T | |
| Velký Luh | 543 | D 3 | |
| Velký Osek | 502, 505 | Ž S T | VS 518 |
| Velký Osek - Kanín | 505 | výhybna | |
| Velký Ratmírov | 701 | výhybna | |
| Velký Šenov | 546 | D 3 | |
| Velvary | 529 | D 3 | |
| Veřovice | 302, 306 | Ž S T | |
| Vesec u Liberce | 548 | Ž S T | |
| Veselí nad Lužnicí | 701, 704, 705 | Ž S T | VS 722 |
| Veselí nad Moravou | 317, 318 | Ž S T | VS 348 |
| Věžky | 315 | Ž S T | |
| Vidnava | 312 | D 3 | |
| Vilémov u Kadaně | 534 | Ž S T | |
| Vimperk | 707 | Ž S T | |
| Višňová | 547 | Ž S T | |
| Vítkov | 306 | D 3 | |
| Vizovice | 316 | D 3 | |
| Vladislav | 322 | Ž S T | |
| Vlárský průsmyk | 317 | Ž S T | |
| Vlastec | 702 | Ž S T | |
| Vlastějovice | 516 | Ž S T | |
| Vlašim | 514 | Ž S T | |
| Vlkaneč | 324 | Ž S T | |
| Vlkoš | 318 | Ž S T | |
| Vlkov u Tišnova | 324 | Ž S T | |
| Vlkovice | 536 | D 3 | |
| Vodňany | 708 | Ž S T | |
| Vojkovice nad Ohří | 533 | Ž S T | |
| Vojtanov | 543 | Ž S T | |
| Volary | 707, 708 | Ž S T | |
| Volyně | 707 | D 3 | |
| Votice | 704 | Ž S T | |
| Vraňany | 527, 530 | Ž S T | |
| Vrané nad Vltavou | 523 | Ž S T | |
| Vranov u Stříbra | 713 | Ž S T | |
| Vranovice | 320, 321 | Ž S T | |
| Vratimov | 302 | Ž S T | ( OKD-D ) |
| Vráž u Berouna | 520 | Ž S T | |
| Vráž u Písku | 715 | Ž S T | |
| Vrbátky | 315 | Ž S T | |
| Vrbno nad Lesy | 529 | Ž S T | |
| Vrbno pod Pradědem | Dopravce: OKD-D | D 3 | (310) |
| Vrbovce - ŽSR | 318 | Ž S T | PPS |
| Vrchlabí | 510 | Ž S T | |
| Vroutek | 719 | Ž S T | |
| Vsetín | 304, 308 | Ž S T | |
| Všestary | 511 | Ž S T | |
| Všetaty | 503, 537 | Ž S T | VS 530 |
| Vysoké Mýto | 517 | Ž S T | |
| Vysoké Mýto město | 517 | D 3 | |
| Vyškov na Moravě | 315 | Ž S T | |
| Vyšší Brod klášter | 706 | D 3 |
| Záboří nad Labem | 501 | Ž S T | |
| Záboří u Číčenic | 708 | Ž S T | |
| Zábřeh na Moravě | 309, 311 | Ž S T | VS 326 |
| Zadní Třebaň | 521, 715 | Ž S T | |
| Záhoří | 702 | Ž S T | |
| Zahrádky u České Lípy | 539 | Ž S T | |
| Zaječí | 319, 320 | Ž S T | |
| Zákupy | 545 | Ž S T | |
| Zámrsk | 501 | Ž S T | |
| Zásmuky | 518 | D 3 | |
| Zastávka u Brna | 322 | Ž S T | |
| Zátoň | 707 | D 3 | |
| Zavidov | 522 | D 3 | |
| Zbečno | 520 | Ž S T | |
| Zbiroh | 713 | Ž S T | |
| Zborovice | 304 | D 3 | |
| Zbraslavice | 515 | Ž S T | |
| Zbytiny | 708 | D 3 | |
| Zdětín u Chotětova | 537 | Ž S T | |
| Zdice | 713, 715 | Ž S T | VS 702 |
| Zdounky | 304 | D 3 | |
| Zlatá Koruna | 707 | Ž S T | |
| Zlaté Hory | 312 | D 3 | |
| Zlín střed | 316 | Ž S T | |
| Zlín - Malenovice | 316 | Ž S T | |
| Zliv | 709 | Ž S T | |
| Zlonice | 529, 530 | Ž S T | |
| Znojmo | 322, 323 | Ž S T | VS 336 |
| Zruč nad Sázavou | 515, 516 | Ž S T | |
| Zvoleněves | 529 | Ž S T |
| Žabokliky | 719 | Ž S T | |
| Žacléř | 509 | D 3 | |
| Žalhostice | 539 | Ž S T | |
| Žamberk | 513 | Ž S T | |
| Žatec | 528, 531 | Ž S T | VS 554 |
| Žatec západ | 531, 719 | Ž S T | |
| Ždánice | 319 | D 3 | |
| Žďár nad Sázavou | 324, 325 | Ž S T | VS 340 |
| Žďárec u Skutče | 507 | Ž S T | VS 514 |
| Ždírec nad Doubravou | 507 | Ž S T | |
| Ždírec u Plzně | 709 | Ž S T | |
| Železná Ruda | 711 | Ž S T | |
| Železná Ruda město | 711 | D 3 | |
| Železný Brod | 508, 548 | Ž S T | |
| Želina | 534 | D 3 | |
| Žihle | 719 | Ž S T | |
| Žichovice | 710 | Ž S T | |
| Žizníkov | 540, 545 | výhybna | |
| Žleby | 515 | D 3 | |
| Žlutice | 522 | Ž S T | |
| Žulová | 312 | Ž S T |